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后天免疫缺乏綜合癥患者所遭遇嚴(yán)重的病理呈現(xiàn)，主要源自于人類免疫缺乏病毒的感染。此病毒屬于一種反轉(zhuǎn)錄病毒，主要針對人類免疫系統(tǒng)重要的組成進(jìn)行感染并改變其運(yùn)作模式，包括輔助型T細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、和樹突細(xì)胞（dendritic cell）等，其中又以直接破壞細(xì)胞膜上具有CD4辨識蛋白特征的T細(xì)胞（簡寫作CD4+T細(xì)胞）的結(jié)果最為嚴(yán)重，因?yàn)镃D4+ T細(xì)胞是人體免疫系統(tǒng)辨識外來物質(zhì)過程中，不可或缺的元素之一，一旦CD4+T細(xì)胞受到感染而不表現(xiàn)CD4辨識蛋白，或甚至造成此種細(xì)胞死亡，導(dǎo)致每微升血液中CD4+T細(xì)胞數(shù)量低于200時(shí)，細(xì)胞免疫（cellular immunity）就幾乎完全失去功能，進(jìn)而導(dǎo)致平時(shí)不易感染健康人類的微生物得以大肆入侵，由于受艾滋病病毒感染個(gè)體無法有效分辨敵我，最后導(dǎo)致嚴(yán)重的各種感染癥，總稱后天免疫缺乏綜合癥, 即通常說的艾滋病。

根據(jù)流行病學(xué)統(tǒng)計(jì)，在未使用抗反轉(zhuǎn)錄病毒藥物治療的情況下，自感染病毒至出現(xiàn)癥狀的潛伏過程的中位數(shù)約為9至10年，自正式出現(xiàn)后天免疫缺乏綜合癥起算，存活時(shí)間的中位數(shù)亦僅有9.2個(gè)月. 然而，臨床觀察到的疾病進(jìn)程速度受到許多因素影響，在個(gè)體之間有很大的變異，短則兩周、長可達(dá)20年。一般年長者免疫力較差，因此相對于年輕患者而言，病程發(fā)展迅速的風(fēng)險(xiǎn)較高；醫(yī)療的品質(zhì)和同時(shí)存在的感染癥（如結(jié)核）也會使得艾滋病病毒感染者處于較為不利的狀態(tài); 遺傳也左右了感染過程和感染后的狀況，有些人因帶有編號為CCR5-Δ32的突變基因，對特定的艾滋病病毒病毒株具有抵抗力。此外，由于艾滋病病毒病毒本身在演化過程中亦會產(chǎn)生變異，不同品系也可引起不同程度的臨床表現(xiàn)。

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