導致同種異體免疫排斥反應的主要原因是供j；受者之間主要組織相容性抗原（major histocompatibility antigen，MHC）的不同。另外，次要組織相容性抗原（minor histocompatibility antigen，mHC）、ABO血型抗原、組織特異性抗原等，在同種移植免疫反應中亦起著一定的作用。引起免疫應答的供者移植物抗原稱為移植抗原。

　　主要組織相容性抗原：組織相容性是指不同個體問進行組織器官移植時，供者和受者雙方相互接受的程度。編碼最強移植抗原的基因座位即為主要組織相容性復合體（MHC），其編碼的抗原即為主要組織相容性抗原。MHC主要表達在細胞膜表面，是引發(fā)同種移植排斥反應的最芷要的抗原。在人類，編碼主要組織相容性抗原的MHC位于6號染色體短臂，其產(chǎn)物為MHC分子，又稱人類白細胞抗原（HLA），包括MHC.I類、Ⅱ類分子。

　　MHC-I類分子（HLA_A、B、C）表達于所有的有核細胞表面，而MHGⅡ類分子（HLA- DR、DQ、DP）通常只表達于專職抗原遞呈細胞（profession antigen presenting cell，PAPC）：表面，如樹突狀細胞（dendritic cell，DC）、巨噬細胞（macrophage）及活化的8細胞和T細胞，也可表達于內(nèi)皮細胞表面。MHC具有廣泛的多態(tài)性，這就使得HLA分子能夠結(jié)合無數(shù)的抗原肽，并引起同種移植免疫反應。

　　由于HLA  I、Ⅱ類分子抗原結(jié)合部位空間結(jié)構(gòu)上的差異，其結(jié)合的抗原類型也是不同的。

　　HLA_ I類分子通常結(jié)合細胞自身合成的抗原，即內(nèi)源性抗原；HLAIII類分子主要結(jié)燴外來抗原。HLA-I類分子主要將內(nèi)源性抗原肽和病毒抗原遞呈給CD8細胞毒性T細胞（CTL），而HLA-Ⅱ類分子主要遞呈外來抗原肽給CD4輔助性T細胞（Th）。