細菌分類主要依據(jù)以下幾個方面：
1. 形態(tài)學特征：通過顯微鏡觀察細菌的大小、形狀和排列方式，如球形（球菌）、桿狀（桿菌）或螺旋形等。
2. 生理生化特性：包括營養(yǎng)需求、代謝產(chǎn)物、酶活性及耐藥性等方面。例如，某些細菌能夠分解特定底物產(chǎn)生氣體或者改變培養(yǎng)基顏色，這些都可以作為分類依據(jù)。
3. 培養(yǎng)特征：觀察細菌在不同種類的培養(yǎng)基上的生長情況，如菌落形態(tài)、顏色、邊緣等。
4. 革蘭氏染色反應：根據(jù)細胞壁結構的不同，將細菌分為革蘭陽性菌和革蘭陰性菌兩大類。這是細菌分類中非常重要的一個步驟。
5. DNA堿基組成與序列分析：通過測定G C含量或進行16S rRNA基因測序等方法來確定不同菌種之間的親緣關系。
6. 抗原結構：某些特定的抗原可以用來區(qū)分不同的血清型，如O抗原和H抗原在腸道桿菌中的應用。
7. 生態(tài)學特性：了解細菌的生活環(huán)境、宿主范圍及其與人類疾病的關系等信息也有助于分類研究。