1、膽結(jié)石：膽結(jié)石可致膽絞痛，易與右側(cè)腎絞痛相混淆。膽結(jié)石合并有膽囊炎時，可出現(xiàn)右上腹部持續(xù)性疼痛，陣發(fā)性加劇，墨菲征陽性。右肋緣下有時可有觸痛并隨呼吸移動的腫大膽囊，或邊界不清、活動度不大而有觸痛的被大網(wǎng)膜包裹的包塊。膽結(jié)石病人尿常規(guī)檢查一般正常，B超檢查可以確定診斷。

2、腎結(jié)核：腎結(jié)石合并有梗阻和感染時應與腎結(jié)核相鑒別。腎結(jié)核往往有慢性頑固的膀胱刺激癥狀，經(jīng)一般抗生素治療無明顯效果；尿中有膿細胞，而普通尿培養(yǎng)無細菌生長;有時伴有肺結(jié)核或腎臟的小結(jié)核病灶；膀胱鏡檢查可見充血水腫、結(jié)核性結(jié)節(jié)、結(jié)核性潰瘍、結(jié)核性肉芽腫和瘢痕形成等病變，在膀胱三角區(qū)和輸尿管開口附近病變尤為明顯。輸尿管口常呈洞穴狀，有時見混濁尿液排出;鈣化型腎結(jié)核在平片可見全腎廣泛鈣化，局灶性者在腎內(nèi)可見斑點鈣化陰影。腎結(jié)核造影的早期X線表現(xiàn)為腎盞邊緣不整齊，有蟲蛀樣改變，嚴重者可見腎盞閉塞、空洞形成，腎盞腎盂不規(guī)則擴大或模糊變形。

3、海綿腎：海綿腎的發(fā)病率為1/5000，患者的腎髓質(zhì)集合管呈囊狀擴張，大體外觀如海綿狀。70%病例存在雙側(cè)腎病變，每個腎臟有1個至數(shù)個乳頭受累。本病出生時即存在，但無癥狀，通常到40～50歲因發(fā)生結(jié)石或感染合并癥才被發(fā)現(xiàn)。集合管擴張造成長期的尿液滯留，加上經(jīng)常合并的高尿鈣癥，是發(fā)生結(jié)石和感染的原因腎小管濃縮和酸化功能常受損。腹部平片可見腎臟大小正?；蜉p度增大，腎區(qū)內(nèi)可見成簇的多發(fā)性結(jié)石（在乳頭區(qū)呈放射狀排列）。靜脈腎盂造影見到的髓質(zhì)集合管呈扇狀囊狀擴張為診斷本病的依據(jù)。

4、腎盂腫瘤：腎盂腫瘤多為乳頭狀瘤，良性與惡性之間常無明顯界限，轉(zhuǎn)移途徑與腎癌相同；由于腎盂壁薄，周圍淋巴組織豐富，所以常有早期淋巴轉(zhuǎn)移。該病多在40歲以后發(fā)生，男性多于女性。早期表現(xiàn)為無痛性血尿，但無明顯腫塊;晚期因腫瘤增大，造成梗阻時可出現(xiàn)腫塊。尿沉渣檢查有時可見腫瘤細胞，血尿時膀胱鏡檢查可見患側(cè)輸尿管口噴血。在造影片上有充盈缺損，需與透X線結(jié)石鑒別。CT和B超可協(xié)助鑒別。

5、膽道蛔蟲癥：腎結(jié)石病人出現(xiàn)腎絞痛時，應與膽道蛔蟲病進行鑒別。膽道蛔蟲主要表現(xiàn)為劍突下陣發(fā)性“鉆頂樣”劇烈絞痛，其特點為發(fā)作突然，緩解亦較迅速。疾病發(fā)作時，病人常輾轉(zhuǎn)不安，全身出汗，甚至臉色蒼白，四肢發(fā)冷，并常伴有惡心嘔吐，嘔吐物可含膽汁甚或蛔蟲。發(fā)作間歇期，疼痛可完全消失。有時疼痛可放射至右肩部或背部。B超可明確診斷。

6、急性闌尾炎：右側(cè)腎結(jié)石病人出現(xiàn)腎絞痛時，應注意與急性闌尾炎進行鑒別。轉(zhuǎn)移性右下腹痛是急性闌尾炎的特點。70%～80%的病人，在發(fā)病開始時感覺上腹疼痛，數(shù)小時至十幾小時后轉(zhuǎn)移至右下腹部。上腹部疼痛一般認為是內(nèi)臟神經(jīng)反射引起，而右下腹痛則為炎癥刺激右下腹所致。

7、急性胰腺炎：腹痛是急性胰腺炎的主要癥狀。腹痛常開始于上腹部，但亦可局限于右上腹或左上腹部，視病變侵犯的部位而定。

8、卵巢囊腫蒂扭轉(zhuǎn)：腎結(jié)石女性病人出現(xiàn)腎絞痛時應注意與卵巢囊腫蒂扭轉(zhuǎn)相鑒別。卵巢囊腫蒂扭轉(zhuǎn)的典型癥狀為突然發(fā)生劇烈腹痛，甚至發(fā)生休克、惡心、嘔吐。婦科檢查發(fā)現(xiàn)有壓痛顯著、張力較大的腫塊并有局限性肌緊張。如果扭轉(zhuǎn)發(fā)生緩慢，則疼痛較輕，有時扭轉(zhuǎn)能自行復位，疼痛也隨之緩解。

9、淋巴結(jié)鈣化：若位于腎區(qū)內(nèi)，可誤診為腎結(jié)石。淋巴結(jié)鈣化為圓形顆粒狀致密影，內(nèi)部不均勻，且多發(fā)、散在，靜脈尿路造影片加側(cè)位片有助與腎結(jié)石區(qū)別。

10、其他：腎結(jié)石還應與其他引起腰背痛、腹痛的有關(guān)疾病進行鑒別，如宮外孕破裂、胃炎、胃潰瘍等疾病。