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新技術(shù)同時檢測基因和蛋白表達(dá)

2012-09-13 17:23  來源:醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)    打印 | 收藏 |
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  美國俄亥俄州立大學(xué)的研究人員近日開發(fā)出一種新技術(shù),能同時觀察細(xì)胞中的基因數(shù)量和蛋白表達(dá)。此技術(shù)能夠詳細(xì)分析基因狀態(tài)以及相應(yīng)蛋白表達(dá)之間的關(guān)聯(lián),并更透徹地了解癌癥及其他復(fù)雜疾病。該成果發(fā)表在《Neuro-Oncology》上。

  這種新技術(shù)稱為熒光原位基因蛋白分析(fluorescentiitugeneroteiaay)。它將傳統(tǒng)的熒光原位雜交(FISH)與原位鄰位連接分析(iituroximityligatioaay,簡稱PLA)相結(jié)合。

  PLA分析采用核酸適體(aptamer)或單/多克隆抗體-核酸復(fù)合物作為鄰位連接探針。當(dāng)一對鄰位探針同時識別同一個目標(biāo)蛋白分子時,它們將在空間位置上相互臨近,通過連接反應(yīng)形成一段可擴(kuò)增的DNA標(biāo)簽序列,該標(biāo)簽序列能夠反映待測蛋白的種類及濃度。

  文章的作者之一,俄亥俄州立大學(xué)的ArnaChakravarti博士表示:“據(jù)我所知,這是目前第一個技術(shù),能讓我們了解同一細(xì)胞中的基因活性和相應(yīng)蛋白表達(dá)。了解腫瘤中的基因和蛋白表達(dá)變化,有助于我們了解是什么驅(qū)動了腫瘤行為。”

  文章的通訊作者,亞拉巴馬大學(xué)副教授Markuredel及其同事首先分析了固定的人膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞,然后分析了石蠟包埋的人膠質(zhì)母細(xì)胞瘤組織。在這兩個分析中,他們都發(fā)現(xiàn)了一種表皮生長因子受體基因的突變形式(EGFRvIII)的過表達(dá),并在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中發(fā)現(xiàn)了截短蛋白。

  他們認(rèn)為,這種方法有潛力詳細(xì)分析細(xì)胞和組織中癌基因狀態(tài)及相應(yīng)蛋白表達(dá)之間的關(guān)聯(lián)。他們表明,熒光原位基因蛋白分析能夠在細(xì)胞水平分辨癌基因和蛋白,這對于異質(zhì)性疾病(如癌癥)特別重要。

  因表觀遺傳學(xué)和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的作用,這種方法對癌癥研究很有用。它將基因和蛋白信息相關(guān)聯(lián),能提高生物標(biāo)志物篩選的可靠性。它還能輔助治療決策,因為有時只篩選基因或蛋白產(chǎn)生了不確定的結(jié)果。

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