摘要: Cell創(chuàng)刊于1976年,現(xiàn)已成為世界自然科學(xué)研究領(lǐng)域最著名的期刊之一,并陸續(xù)發(fā)行了十幾種姊妹刊,在各自專業(yè)領(lǐng)域里均占據(jù)著舉足輕重的地位。Cell以發(fā)表具有重要意義的原創(chuàng)性科研報(bào)告為主,許多生命科學(xué)領(lǐng)域最重要的發(fā)現(xiàn)都發(fā)表在Cell上。
1. Royal Wedding
近期最受全球關(guān)注的婚禮莫過于即將舉行的英國威廉王子婚禮,作為十幾個(gè)英聯(lián)邦國家未來的國王,他的婚禮備受各界矚目。目前這一婚禮已經(jīng)進(jìn)入了最后幾天倒計(jì)時(shí),各大型媒體也都密切關(guān)注中,而作為生命科學(xué)領(lǐng)域的頂級(jí)雜志《Cell》也發(fā)文:Royal Wedding,并在“Cell Culture”欄目中從更多生物學(xué)角度來剖析這一世紀(jì)婚禮。
2. Hallmarks of Cancer: The Next Generation
Douglas Hanahan, Robert A. Weinberg
這是一篇經(jīng)典的介紹癌癥特征的文章,作者是Robert A.Weinberg,這位著名的科學(xué)家是美國科學(xué)院院士,世界著名的Whitehead研究所創(chuàng)始人之一,他曾發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)人類癌基因Ras和第一個(gè)抑癌基因Rb,他的一系列杰出研究工作已經(jīng)成為腫瘤研究領(lǐng)域乃至整個(gè)醫(yī)學(xué)生物學(xué)領(lǐng)域的重要里程碑。
從事腫瘤學(xué)研究的學(xué)者可能都讀過他的一篇文章:The Hallmarks of Cancer,這篇綜述性文章介紹了腫瘤細(xì)胞的六大基本特征,被稱為腫瘤學(xué)研究的經(jīng)典論文,到目前為止,這篇論文已經(jīng)被引用了上萬次。
3月新出版的Cell雜志上,Weinberg教授又發(fā)表了一篇升級(jí)版綜述:Hallmarks of Cancer: The Next Generation,這篇同樣也是與Douglas Hanahan合作的論文長達(dá)29頁,簡(jiǎn)述了最近10年腫瘤學(xué)中的熱點(diǎn)和進(jìn)展,包括細(xì)胞自噬、腫瘤干細(xì)胞、腫瘤微環(huán)境等等,并且將原有的腫瘤細(xì)胞六大特征擴(kuò)增到了十個(gè),這十個(gè)特征分別是:
自給自足生長信號(hào)(Self-Sufficiency in Growth Signals);抗生長信號(hào)的不敏感(Insensitivity to Antigrowth Signals);抵抗細(xì)胞死亡(Resisting Cell Death);潛力無限的復(fù)制能力(Limitless Replicative Potential);持續(xù)的血管生成(Sustained Angiogenesis);組織浸潤和轉(zhuǎn)移(Tissue Invasion and Metastasis);避免免疫摧毀(Avoiding Immune Destruction);促進(jìn)腫瘤的炎癥(Tumor Promotion Inflammation); 細(xì)胞能量異常(Deregulating Cellular Energetics);基因組不穩(wěn)定和突變(Genome Instability and Mutation)。
3. No-Nonsense Functions for Long Noncoding RNAs
Takashi Nagano, Peter Fraser
長鏈非編碼RNA(IncRNA)是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200nt的RNA分子,它們并不編碼蛋白,而是以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等)調(diào)控基因的表達(dá)水平。
長鏈非編碼RNAs是哺乳動(dòng)物轉(zhuǎn)錄組的重要成分,但是其功能目前并不十分清楚。研究人員經(jīng)過詳細(xì)分析,發(fā)現(xiàn)一些長鏈非編碼RNAs能使基因沉默,比如在X染色體失活和基因印記過程。研究人員還發(fā)現(xiàn)在去除一些長鏈非編碼RNAs后,其相鄰的蛋白編碼基因的表達(dá)會(huì)降低,而一些基因表達(dá)的激活則需要這種RNAs的參與。更加重要的是,非編碼RNAs在發(fā)育和分化相關(guān)的關(guān)鍵調(diào)控自的轉(zhuǎn)錄激活過程中,扮演了重要角色,因此也為治療包括癌癥在內(nèi)的疾病提供了新的思路。
4. Wdr5 Mediates Self-Renewal and Reprogramming via the Embryonic Stem Cell Core Transcriptional Network
Yen-Sin Ang, Su-Yi Tsai, Dung-Fang Lee, Jonathan Monk, Jie Su, Kajan Ratnakumar, Junjun Ding, Yongchao Ge, Henia Darr, Betty Chang et al.
wdr5是trxG的一個(gè)成員,在細(xì)胞中有兩組與發(fā)育和癌癥發(fā)生有關(guān)的先反作用的兩大復(fù)合體,一個(gè)是PcG蛋白組成的復(fù)合體主要是介導(dǎo)的基因沉默,另一個(gè)是trxG蛋白,這里的wdr5就是其中的一個(gè)成員,一般的trxG介導(dǎo)的是基因的激活,它們對(duì)于發(fā)育過程中的動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)非常的重要。這篇文章證明了wdr5與未分化的ES細(xì)胞是相關(guān)的,而且能夠與oct4相互作用。
5. Hydroxylation of 5-Methylcytosine by TET1 Promotes Active DNA Demethylation in the Adult Brain
Junjie U. Guo, Yijing Su, Chun Zhong, Guo-li Ming, Hongjun Song
來自美國約翰;艚鹚勾髮W(xué)的科學(xué)家們?cè)谌祟惸I細(xì)胞和成年小鼠腦組織中解析了促使DNA序列發(fā)生與癌癥、精神疾病及神經(jīng)退行性疾病相關(guān)的關(guān)鍵性化學(xué)改變——DNA去甲基化的機(jī)制。
DNA是生物遺傳密碼的攜帶者和傳遞者,DNA的核苷酸序列是遺傳信息的重要貯存形式。DNA通過轉(zhuǎn)錄的方式合成信使RNA,并最終指導(dǎo)合成功能性蛋白而執(zhí)行細(xì)胞的各種生理任務(wù),延續(xù)生物體機(jī)能。當(dāng)在DNA的某些特殊位點(diǎn)的堿基上添入或除去甲基基團(tuán)化學(xué)修飾時(shí),則有可能引起染色體結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA穩(wěn)定性以及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式發(fā)生改變,從而影響基因表達(dá)。
在這篇文章中研究人員首先利用幾種不同的化合物誘導(dǎo)細(xì)胞DNA上的胞嘧啶(C)發(fā)生甲基化改變,并在隨后觀察了甲基化胞嘧啶(mC)的變化。在兩天里,研究人員并未觀察到發(fā)生任何改變,然而當(dāng)他們將一種稱為TET1的蛋白添加到細(xì)胞中時(shí),發(fā)現(xiàn)某些甲基化的胞嘧啶轉(zhuǎn)化為了羥甲基胞嘧啶(hmC),而某些則逆轉(zhuǎn)為普通的胞嘧啶,這表明TET1促使DNA上的胞嘧啶發(fā)生了脫甲基化。而當(dāng)研究人員向細(xì)胞中加入另一種Apobec1蛋白時(shí),發(fā)現(xiàn)脫甲基化過程得以進(jìn)一步增強(qiáng)。
在接下來的試驗(yàn)中,研究人員對(duì)過去發(fā)表的一項(xiàng)研究工作展開了更深入的研究。在當(dāng)時(shí)發(fā)表的研究論文中宋洪軍曾證實(shí)電休克治療(ECT)中的電刺激可促使小鼠中大腦細(xì)胞的生長,這一效應(yīng)有可能是DNA甲基化狀態(tài)改變的結(jié)果。在新研究中,研究人員將研究小鼠分為ECT樣電刺激處理組及對(duì)照組,然后利用遺傳工具結(jié)合PCR技術(shù)對(duì)來自這些小鼠大腦組織細(xì)胞中的基因組微小區(qū)域進(jìn)行了擴(kuò)增,隨后對(duì)這些DNA片段上胞嘧啶狀態(tài)進(jìn)行了比較分析。利用先進(jìn)的基因測(cè)序技術(shù),研究人員分析了兩組小鼠腦細(xì)胞中DNA特殊區(qū)域的胞嘧啶甲基化狀態(tài)包括普通胞嘧啶、甲基化胞嘧啶、羥甲基胞嘧啶。研究結(jié)果表明ECT確實(shí)誘導(dǎo)DNA發(fā)生了去甲基化,而TET1是這一過程的關(guān)鍵性作用因子。
6. Ribosome-Mediated Specificity in Hox mRNA Translation and Vertebrate Tissue Patterning
Nadya Kondrashov, Aya Pusic, Craig R. Stumpf, Kunihiko Shimizu, Andrew C. Hsieh, Shifeng Xue, Junko Ishijima, Toshihiko Shiroishi, Maria Barna
7. Activity-Dependent IGF-1 Exocytosis Is Controlled by the Ca2+-Sensor Synaptotagmin-10
Peng Cao, Anton Maximov, Thomas C. Südhof
8. A Rapid and Scalable System for Studying Gene Function in Mice Using Conditional RNA Interference
Prem K. Premsrirut, Lukas E. Dow, Sang Yong Kim, Matthew Camiolo, Colin D. Malone, Cornelius Miething, Claudio Scuoppo, Johannes Zuber, Ross A. Dickins, Scott C. Kogan et al.
RNA干擾是一種研究基因功能的強(qiáng)有力工具,然而RNA干擾的轉(zhuǎn)基因小鼠的重復(fù)形成顯著受限。通過用高效胚胎干細(xì)胞靶整合優(yōu)化熒光耦合miR30為基礎(chǔ)的小發(fā)夾RNA,我們建立了一種用于生產(chǎn)小發(fā)夾RNA轉(zhuǎn)基因小鼠的快速可擴(kuò)展管道。我們用這個(gè)系統(tǒng)生成了八種 tet-調(diào)節(jié)的小發(fā)夾RNA轉(zhuǎn)基因系即體內(nèi)廣泛敲除Firefly和海腎熒光素酶、Oct4和腫瘤抑制基因p53, p16INK4a, p19ARF、APC、demonstrate 強(qiáng)大的基因沉默、GFP-tracked.進(jìn)一步用一個(gè)小發(fā)夾RNA 作用于APC,我們闡明了這種方法如何為良好研究的基因鑒定預(yù)測(cè)表型及其功能。另外通過調(diào)節(jié)基因沉默,我們分別確認(rèn)了T細(xì)胞急性淋巴細(xì)胞白血病/淋巴瘤和肺腺癌中潛在的治療靶點(diǎn)APC/Wnt和p19ARF.不論其為何種哺乳動(dòng)物基因轉(zhuǎn)染,這個(gè)系統(tǒng)為RNA干擾轉(zhuǎn)基因小鼠的生產(chǎn)提供了一個(gè)具有成本效益的可擴(kuò)展平臺(tái)。
9. Macrophages in the Pathogenesis of Atherosclerosis
Kathryn J. Moore, Ira Tabas
10. Arabidopsis Argonaute10 Specifically Sequesters miR166/165 to Regulate Shoot Apical Meristem Development
Hongliang Zhu, Fuqu Hu, Ronghui Wang, Xin Zhou, Sing-Hoi Sze, Lisa Wen Liou, Ashley Barefoot, Martin Dickman, Xiuren Zhang
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