經(jīng)過(guò)全國(guó)十幾所高等藥學(xué)院校及有關(guān)專(zhuān)家調(diào)研論證，執(zhí)業(yè)藥師繼續(xù)教育整個(gè)課程體系分為兩大類(lèi)，一是藥學(xué)類(lèi)，二是中藥學(xué)類(lèi)。

每一大類(lèi)里又分為專(zhuān)業(yè)基礎(chǔ)課、專(zhuān)業(yè)課、拓展課和研討課四種，課程總數(shù)為32門(mén)。藥學(xué)類(lèi)共設(shè)20門(mén)課程，其中專(zhuān)業(yè)基礎(chǔ)課3門(mén)、專(zhuān)業(yè)課6門(mén)、拓展課6門(mén)、研討課5門(mén)。中藥學(xué)類(lèi)共設(shè)20門(mén)課程。其中專(zhuān)業(yè)基礎(chǔ)課4門(mén)、專(zhuān)業(yè)課6門(mén)、拓展課5門(mén)、研討課5門(mén)。在藥學(xué)類(lèi)和中藥學(xué)類(lèi)課程中，內(nèi)容完全相同的有8門(mén)課程，故采用同一個(gè)教學(xué)大綱，稱為共用課程翳學(xué)教育網(wǎng)搜集整理。

如果同時(shí)考取了執(zhí)業(yè)中藥師和執(zhí)業(yè)西藥師，繼續(xù)教育時(shí)只要取得15學(xué)分即可，也就是說(shuō)不用為了兩個(gè)證書(shū)分別繼續(xù)教育。