上海交通大學(xué)藥學(xué)院由上海交通大學(xué)和上海醫(yī)藥工業(yè)研究院共建，于2000年2月26日成立。藥學(xué)院是上海交通大學(xué)的二級學(xué)院，主要任務(wù)是招收和培養(yǎng)本科生、研究生（碩士、博士），學(xué)科建設(shè)、科學(xué)研究、技術(shù)開發(fā)、成果產(chǎn)業(yè)化等醫(yī)|學(xué)教育網(wǎng)。

藥學(xué)院傳承上海交通大學(xué)追求卓越的信念，以建設(shè)世界藥學(xué)院為奮斗目標(biāo)，踐行知識傳授、能力建設(shè)和人格養(yǎng)成的“三位一體”人才培養(yǎng)理念，以本科教育為立院之本、科研為強(qiáng)院之路，充分發(fā)揮學(xué)科齊全、研究力量雄厚的優(yōu)勢，堅持教學(xué)和科研并重，培養(yǎng)綜合素質(zhì)高、專業(yè)知識面寬、業(yè)務(wù)能力強(qiáng)、具有競爭力的研究型和創(chuàng)新型藥學(xué)本科人才。

具有藥學(xué)博士后流動站、藥學(xué)博士學(xué)位授予權(quán)、藥學(xué)和中藥學(xué)碩士學(xué)位授予權(quán)。2010年全球?qū)W科排名中藥理學(xué)與毒理學(xué)躋身ESI全球研究機(jī)構(gòu)的前1%行列，4月-6月間該領(lǐng)域國際論文被引總頻次增長速度居全球之冠，榮登ESI“RisingStar”醫(yī)|學(xué)教育網(wǎng)。先后承擔(dān)國家重大科學(xué)研究計劃、“973計劃”、國家自然科學(xué)基金、“國家重大新藥創(chuàng)制”重大專項(xiàng)、“863計劃”、“支撐計劃”等眾多國家級重大和重點(diǎn)項(xiàng)目以及省部級重大和重點(diǎn)項(xiàng)目、國內(nèi)外橫向合作研究項(xiàng)目。近五年來，授權(quán)發(fā)明專利80余項(xiàng)，發(fā)表SCI/EI論文500余篇，其中在Science，NatureReviewDrugDiscovery，Journa1ofProteomeResearch，CancerResearch等國際期刊發(fā)表了數(shù)十篇有較大影響的學(xué)術(shù)論文。擁有“細(xì)胞工程及抗體藥物”教育部工程研究中心（籌）、國家中醫(yī)藥管理局三級實(shí)驗(yàn)室、國家“重大新藥創(chuàng)制”技術(shù)平臺，以及“臨床評價研究技術(shù)平臺-臨床藥物動力學(xué)和藥物代謝組”建設(shè)點(diǎn)等重要平臺基地。