北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部科研平臺：

國家重點實驗室：天然藥物及仿生藥物國家重點實驗室。

國家工程實驗室：口腔數(shù)字化醫(yī)療技術(shù)和材料國家工程實驗室。

教育部重點實驗室：分子心血管學(xué)教育部重點實驗室、醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)搜集|整理神經(jīng)科學(xué)教育部重點實驗室、惡性腫瘤發(fā)病機(jī)制及轉(zhuǎn)化研究教育部重點實驗室、視覺損傷與修復(fù)教育部重點實驗室、慢性腎臟病防治教育部重點實驗室、輔助生殖教育部重點實驗室。

教育部工程研究中心：再生醫(yī)學(xué)教育部工程研究中心。

衛(wèi)生部重點實驗室：衛(wèi)生部精神衛(wèi)生學(xué)重點實驗室、衛(wèi)生部神經(jīng)科學(xué)重點實驗室、衛(wèi)生部腎臟疾病重點實驗室、衛(wèi)生部醫(yī)學(xué)免疫重點實驗室、衛(wèi)生部心血管分子生物學(xué)與調(diào)節(jié)肽重點實驗室、衛(wèi)生部生育健康重點實驗室。

衛(wèi)生部工程研究中心：衛(wèi)生部口腔醫(yī)學(xué)計算機(jī)應(yīng)用工程技術(shù)研究中心。

北京市重點實驗室：皮膚病分子診斷北京市重點實驗室、造血干細(xì)胞移植治療血液病研究北京市重點實驗室、丙型肝炎和肝病免疫治療北京市重點實驗室、脊柱疾病研究北京市重點實驗室、生殖內(nèi)分泌與輔助生殖技術(shù)北京市重點實驗室、磁共振成像設(shè)備與技術(shù)北京市重點實驗室、惡性腫瘤轉(zhuǎn)化研究北京市重點實驗室、食品安全毒理學(xué)研究與評價北京市重點實驗室、蛋白質(zhì)修飾與細(xì)胞功能北京市重點實驗室、兒科遺傳性疾病分子診斷與研究北京市重點實驗室、肝硬化肝癌外科基礎(chǔ)研究北京市重點實驗室、骨與軟組織腫瘤診治研究北京市重點實驗室、癡呆診治轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究北京市重點實驗室等。