中藥化學(xué)數(shù)據(jù)庫tcmd:
擁有幾千年歷史的中草藥,是祖先留給我們的瑰麗的醫(yī)藥寶藏。但是到目前為止對中草藥的系統(tǒng)發(fā)掘和綜合利用還遠(yuǎn)遠(yuǎn)沒有形成規(guī)模。中草藥的提取、分離、藥理研究已有二百多年的歷史。尤其是二十世紀(jì)三十年代以來,中草藥的現(xiàn)代化研究空前繁榮,中外科學(xué)家們利用現(xiàn)代手段對各種中草藥和民間用藥進(jìn)行提取分離、結(jié)構(gòu)鑒定、生物測試和藥理試驗,積累了大量化學(xué)、生物學(xué)和藥理學(xué)的研究資料,而且還在不斷的更新和增加中。這些資料汗牛充棟、極有價值,同時又難免良莠不齊;如何對這些知識進(jìn)行有效的挖掘利用,為新藥的研究開發(fā)、中藥的系統(tǒng)現(xiàn)代化、中藥制劑的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)制定等等相關(guān)領(lǐng)域服務(wù),對于從事和關(guān)心中國醫(yī)藥事業(yè)的科學(xué)家是一項極富挑戰(zhàn)性的工作。
中科院過程工程研究所分子設(shè)計課題組周家駒等化學(xué)和藥學(xué)專業(yè)的工作人員,對幾十年來的相關(guān)資料進(jìn)行了系統(tǒng)收集、整理、和分析;歷時8年建立起一整套中草藥化學(xué)資料的辨識和分析標(biāo)準(zhǔn)。并據(jù)此研制了中藥化學(xué)數(shù)據(jù)庫(TCMD 2003.1),收錄中草藥所含產(chǎn)物的化學(xué)結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)、生物和藥理活性及文獻(xiàn)來源等信息,目前已擁有化學(xué)結(jié)構(gòu)9127個,中草藥及相關(guān)藥用植物3922種。該研究小組以其化學(xué)資料收集、辨識和分析標(biāo)準(zhǔn)對國內(nèi)外最新的研究資料進(jìn)行追蹤整理,每年更新,保證該庫提供最新、最可靠的中草藥天然產(chǎn)物研究成果。
TCMD 2003.1較好地體現(xiàn)了科學(xué)性和實用性的統(tǒng)一:
TCMD數(shù)據(jù)庫是利用MDL公司的化學(xué)信息管理系統(tǒng)ISIS/Base & Draw進(jìn)行數(shù)據(jù)管理,在Windows環(huán)境下運行,使用者無需任何專業(yè)計算機知識,即可進(jìn)行檢索、瀏覽、和維護(hù);瘜W(xué)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)以sketch文件(。skc)和mol文件(。mol)保存于數(shù)據(jù)庫中,可以方便地以SDF文件的形式與任何目前存在的分子模擬和設(shè)計軟件系統(tǒng)如Tripos和Accelrys進(jìn)行交互聯(lián)系。ISIS/Base & Draw提供的結(jié)構(gòu)式查詢方式,可以方便地為使用者提供直觀、準(zhǔn)確的結(jié)構(gòu)信息。植物、藥理、文獻(xiàn)信息可通過交叉查詢的方式獲得。
采用確切的立體化學(xué)方式表達(dá)化學(xué)信息;
采用規(guī)范的格式表達(dá)化合物生物活性信息和中藥的功效、適應(yīng)癥和藥理;
采用嚴(yán)格的植物分類系統(tǒng)表達(dá)中藥源植物;
TCMD 2003.1的主要功能和用途有:
對中藥傳統(tǒng)功效、有效成分、現(xiàn)代藥理三類信息進(jìn)行連接及整合,用綜和方法研究中藥現(xiàn)代化的有用工具;
是藥物設(shè)計學(xué)中進(jìn)行QSAR研究的豐富的數(shù)據(jù)源;
組合庫的設(shè)計、化合物虛擬篩選、三維藥效團(tuán)的搜索等,醫(yī)|學(xué)教育|網(wǎng)搜集整理以發(fā)現(xiàn)有潛力的化合物進(jìn)入研究開發(fā)。由于TCMD中集中了中草藥中有藥理活性的化合物且其結(jié)構(gòu)的多樣性非常好,其篩選效率要遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于普通的結(jié)構(gòu)庫。
是從中草藥資源出發(fā),開發(fā)中藥新劑型產(chǎn)品的有用工具。
多途徑的文字及數(shù)據(jù)檢索功能及含立體化學(xué)的二維結(jié)構(gòu)檢索功能,為從事藥物化學(xué)、植物化學(xué)、生藥學(xué)、中藥現(xiàn)代化研究的研究人員提供方便快捷的中草藥成分、結(jié)構(gòu)、以及所有已存在的研究資料信息,大大節(jié)省文獻(xiàn)檢索的時間和人員浪費。
TCMD 2003.1產(chǎn)品的相關(guān)內(nèi)容該產(chǎn)品第一部分內(nèi)容是從1800多篇(部)中英文書籍和研究論文中收集了9127種從中草藥中分離出來的化合物信息。每種化合物下列10項數(shù)據(jù):唯一代碼、中文名稱、英文名稱、CAS登錄號、分子式、分子量、物理化學(xué)性質(zhì) (晶體形態(tài)、熔點、沸點、旋光度等)、格式化的生物活性數(shù)據(jù) (即藥理模型實驗結(jié)果,約3000種化合物有此數(shù)據(jù))、含有該化合物的中藥名單、含立體化學(xué)信息的結(jié)構(gòu)式和參考文獻(xiàn)。
下一篇:藥劑學(xué)年薪
1、凡本網(wǎng)注明“來源:醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)”的所有作品,版權(quán)均屬醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)所有,未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、鏈接、轉(zhuǎn)貼或以其他方式使用;已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)的,應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用,且必須注明“來源:醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其法律責(zé)任。
2、本網(wǎng)部分資料為網(wǎng)上搜集轉(zhuǎn)載,均盡力標(biāo)明作者和出處。對于本網(wǎng)刊載作品涉及版權(quán)等問題的,請作者與本網(wǎng)站聯(lián)系,本網(wǎng)站核實確認(rèn)后會盡快予以處理。
本網(wǎng)轉(zhuǎn)載之作品,并不意味著認(rèn)同該作品的觀點或真實性。如其他媒體、網(wǎng)站或個人轉(zhuǎn)載使用,請與著作權(quán)人聯(lián)系,并自負(fù)法律責(zé)任。
3、本網(wǎng)站歡迎積極投稿
4、聯(lián)系方式:
編輯信箱:mededit@cdeledu.com
電話:010-82311666
010 82311666
400 650 1888