北京兒童醫(yī)院1988年進(jìn)行住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)試點(diǎn)，2003年進(jìn)行專(zhuān)科醫(yī)師培訓(xùn)試點(diǎn)，試行3＋X培訓(xùn)模式。自1988年以來(lái)，完成第二階段培訓(xùn)的人員總數(shù)培訓(xùn)人數(shù)218人；自1999年以來(lái)，完成第一階段培訓(xùn)的人員總數(shù)109人，目前在培123人（包括本院104人、外院16人）。

北京兒童醫(yī)院現(xiàn)有2個(gè)衛(wèi)生部認(rèn)可的培訓(xùn)基地，即：兒內(nèi)科專(zhuān)科醫(yī)師培訓(xùn)基地、兒外科專(zhuān)科醫(yī)師培訓(xùn)基地�；�地實(shí)行主任負(fù)責(zé)制，兒內(nèi)科基地已從2003年接收來(lái)自非兒科培訓(xùn)基地的學(xué)員，現(xiàn)累計(jì)達(dá)31人。本院的醫(yī)生也嚴(yán)格按北京地區(qū)兒科專(zhuān)科醫(yī)師培訓(xùn)細(xì)則的要求進(jìn)行管理，內(nèi)科系統(tǒng)前3年不分專(zhuān)業(yè)，統(tǒng)統(tǒng)參加專(zhuān)業(yè)輪轉(zhuǎn)，待取得普通專(zhuān)科階段合格證書(shū)后再進(jìn)行亞專(zhuān)業(yè)培訓(xùn)。

兒內(nèi)科普通專(zhuān)科階段的培訓(xùn)要求輪轉(zhuǎn)新生兒、消化、呼吸、心血管、血液、腎臟、神經(jīng)、ICU、感染、內(nèi)分泌及風(fēng)濕、門(mén)急診等專(zhuān)業(yè)，每個(gè)專(zhuān)業(yè)3個(gè)月，還要輪轉(zhuǎn)保健、影像、心電圖各1個(gè)月。要求第1年住院醫(yī)師做24小時(shí)負(fù)責(zé)制，每晚參加夜巡診。

兒外科普通專(zhuān)科階段的培訓(xùn)要求輪轉(zhuǎn)急癥、普外、燒傷整形、骨科、泌外、胸外、心外、神外、麻醉及重癥、新生兒、腫瘤等專(zhuān)業(yè)，每個(gè)專(zhuān)業(yè)2～3個(gè)月，還要輪轉(zhuǎn)門(mén)急診、影像（放射、超聲）。要求第1年住院醫(yī)師做24小時(shí)負(fù)責(zé)制。

培訓(xùn)基地實(shí)行嚴(yán)格培訓(xùn)與考核，每個(gè)專(zhuān)業(yè)輪轉(zhuǎn)結(jié)束時(shí)1個(gè)專(zhuān)業(yè)要參加出科考試；還要參加醫(yī)院組織的年度理論、外語(yǔ)和臨床技能考試。如在培訓(xùn)期間遵守醫(yī)院的各項(xiàng)規(guī)章制度和科室管理，完成安排的專(zhuān)業(yè)輪轉(zhuǎn)、通過(guò)出科考核、年度考核和衛(wèi)生局組織的北京地區(qū)普通專(zhuān)科階段統(tǒng)考，每年病事假不超過(guò)15天，無(wú)醫(yī)德醫(yī)風(fēng)和醫(yī)療差錯(cuò)事故，即可取得衛(wèi)生部頒發(fā)的普通專(zhuān)科醫(yī)師培訓(xùn)合格證書(shū)。

基地目前能解決遠(yuǎn)郊區(qū)縣在培住院醫(yī)師的住宿，但隨著血液及腫瘤中心的建立，將面臨不能提供住宿問(wèn)題，但可協(xié)助安排住宿。培訓(xùn)基地能對(duì)在培訓(xùn)期間提供一定的生活補(bǔ)貼。對(duì)外單位選送人員的生活津貼是按衛(wèi)生局文件下達(dá)的標(biāo)準(zhǔn)發(fā)放，即第1年500元、第2年600元、第3年700元。夜班費(fèi)按實(shí)際出勤發(fā)放，法定節(jié)假日適當(dāng)給予節(jié)日補(bǔ)貼。他們的工資由選送單位發(fā)放。

基地現(xiàn)無(wú)社會(huì)化招生的培訓(xùn)學(xué)員。但曾于2004年招收社會(huì)化培訓(xùn)學(xué)員1名，衛(wèi)生局下?lián)軐?zhuān)款2萬(wàn)元/年，醫(yī)院用此款為培訓(xùn)學(xué)員上四險(xiǎn)，并每月發(fā)放工資1100元，加上額外補(bǔ)助生活費(fèi)和夜班費(fèi)，學(xué)員平均每月收入達(dá)1500元左右。由于個(gè)人原因，該學(xué)員未完成全部培訓(xùn)中途退出。