會(huì)議日期 | 2022-05-14至 2022-05-15 |
會(huì)議地點(diǎn) | 北京豐臺(tái)區(qū) |
會(huì)議學(xué)科 | 科研/教育科研申報(bào) |
主辦單位 | 北京華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司 |
學(xué)分情況 |
2022年5月14日-15日
騰訊會(huì)議客戶端線上授課(非錄播)
二、授課老師:
來(lái)自中科院,長(zhǎng)期從事單細(xì)胞多組學(xué)方面的項(xiàng)目研究,目前已在Nature等雜志發(fā)表文章四十多篇,承擔(dān)國(guó)家科技部、國(guó)家自然基金委和重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等多項(xiàng)課題。
三、會(huì)議特色:
本次課程以近期CNS文章為案例主線,逐一詳細(xì)剖析,全程電腦實(shí)戰(zhàn)教學(xué)。理論與實(shí)踐相結(jié)合,老師將以最簡(jiǎn)單易懂的方式,既介紹單細(xì)胞測(cè)序的研究方法、分析內(nèi)容和最新前沿進(jìn)展,又介紹具體的數(shù)據(jù)庫(kù)、工具和軟件的使用,并在課堂上進(jìn)行上機(jī)指導(dǎo)。講師經(jīng)驗(yàn)豐富,教學(xué)深入淺出,能讓大家獲得從單細(xì)胞組學(xué)原始數(shù)據(jù)實(shí)現(xiàn)CNS圖形繪制的實(shí)戰(zhàn)能力。
四、預(yù)期目標(biāo):
本學(xué)習(xí)班由多年從事單細(xì)胞組學(xué)研究的科研人員授課,通過深入淺出的理論講解和實(shí)例案例,幫助學(xué)員拓展研究思路,提升科研水平,增加職業(yè)競(jìng)爭(zhēng)力。通過本次課程培訓(xùn)將使學(xué)員系統(tǒng)掌握當(dāng)前主流的單細(xì)胞組學(xué)分析流程、方法和軟件,從零基礎(chǔ)實(shí)現(xiàn)到CNS圖表的繪制,同時(shí)提升研究深度和廣度,拓寬研究思路。
五、主要內(nèi)容:
1.熟悉單細(xì)胞組學(xué)圖表解讀和研究思路。
2.掌握單細(xì)胞組學(xué)分析標(biāo)準(zhǔn)流程和常用軟件。
3.熟悉單細(xì)胞數(shù)據(jù)的分型和marker基因鑒定。
4.掌握單細(xì)胞數(shù)據(jù)的軌跡分析及功能富集分析。
5.了解單細(xì)胞課題設(shè)計(jì)方法及研究思路。
6.熟悉并掌握單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)實(shí)用技能。
六、課程安排:
日期
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時(shí)間
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授課題目
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授課內(nèi)容
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5月14日
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9:00-12:00
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單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)與應(yīng)用 | 1. 單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)的發(fā)展和原理。 2. 單細(xì)胞在各個(gè)科研領(lǐng)域的應(yīng)用。 3. 單細(xì)胞高分文章分析思路解析(細(xì)胞群鑒定、擬時(shí)序分析、差異表達(dá)、功能富集、轉(zhuǎn)錄因子、細(xì)胞通訊等)。 4. 單細(xì)胞組學(xué)分析常用數(shù)據(jù)庫(kù)介紹及使用。 |
12:00-14:00
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午間休息
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14:00-17:00
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單細(xì)胞組學(xué)數(shù)據(jù)分析實(shí)操 | 1. R語(yǔ)言簡(jiǎn)介及安裝,RStudio的安裝及使用說明。 2. R語(yǔ)言語(yǔ)法介紹及常用命令。 3. R語(yǔ)言的數(shù)據(jù)處理功能及統(tǒng)計(jì)應(yīng)用。 4. 10X官方單細(xì)胞軟件Cellranger講解及實(shí)操。 5. 從基因表達(dá)矩陣開始到marker基因篩選全過程講解及實(shí)操。 6. 通過Seurat軟件進(jìn)行PCA及tSNE降維。 7. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞鑒定及聚類分析。 8. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組差異分析。 |
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5月15日
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9:00-12:00
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組軌跡、通路、轉(zhuǎn)錄因子等分析及繪圖實(shí)操 | 1. 通過Seurat 合并多樣本及消除樣本異質(zhì)性。 2. 通過Monocle軟件進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組擬時(shí)間分析。 3. 通過DAVID及metascape網(wǎng)站進(jìn)行通路富集分析。 4. 通過GSVA計(jì)算細(xì)胞通路得分信號(hào)等。 5. 通過cellphonedb進(jìn)行細(xì)胞互作分析。 6. 通過infercnv推斷染色體拷貝數(shù)變異。 7. 通過SCENIC軟件進(jìn)行轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)分析。 |
12:00-14:00
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午間休息
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14:00-17:00
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空間轉(zhuǎn)錄組+單細(xì)胞測(cè)序聯(lián)合分析 | 1. 空間轉(zhuǎn)錄組基本概念及原理。 2. 單細(xì)胞及空間轉(zhuǎn)錄組研究思路及案例分享。 3. 單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合課題設(shè)計(jì)。 4. 空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析。 5. 通過Seurat進(jìn)行空間變量特征的識(shí)別。 6. 與單細(xì)胞數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析(空間細(xì)胞類型定義)。 7. 通過Seurat處理多個(gè)切片。 |
會(huì)議費(fèi)3000元/人,此次課程為線上直播教學(xué)模式,開課前統(tǒng)一提供配套電子版培訓(xùn)資料。參加培訓(xùn)的學(xué)員課后可通過微信群繼續(xù)和授課講師交流,長(zhǎng)期獲得指導(dǎo)機(jī)會(huì)。
課程結(jié)束后統(tǒng)一快遞紙質(zhì)版蓋章通知和正式發(fā)票,如提前需要請(qǐng)聯(lián)系會(huì)務(wù)組。
本次會(huì)議費(fèi)委托合肥華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司收取并統(tǒng)一提供會(huì)務(wù)發(fā)票。
1.網(wǎng)上匯款或銀行轉(zhuǎn)賬
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聯(lián)系人:章老師
電 話:13121195178(微信同號(hào))
E-mail:info@huasitai.com
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