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藥物僅影響機體生物功能的進行速度而不能改變現存的自然生物過程或產生新的功能。例如，藥物可加速或減慢引起肌肉收縮的生化反應、腎臟細胞對水、鈉潴留和排除的調節(jié)、腺體的分泌（如粘液、胃酸或胰島素），以及神經對信息的傳遞等。藥物作用的強弱一般取決于靶部位的反應。

藥物可改變生物過程的速率。例如醫(yī)學教育網搜集/整理，一些抗癲癇藥物通過腦組織發(fā)布指令減少某種化學物質的生成從而減少癲癇發(fā)作。然而，藥物不能修復已經超出修復范圍的損傷，這種藥物作用的限制，使得組織損傷或退行性病變如心力衰竭、關節(jié)炎、肌萎縮、多發(fā)性硬化及阿爾茨 海默病的治療十分困難。

每個個體對藥物的反應均有差異。為達到同一療效，體重較重的人比較輕的人需要更多的藥量。新生兒和老年人對藥物的代謝慢于兒童和青年人。肝腎病患者對藥物的清除亦比正常人困難。

每種新藥的標準劑量或平均劑量由動物試驗和人的試驗決定。但平均劑量表面上被定義為“適合所有人的劑量”，其實它只對一定范圍的個體適用，并不完全適合每個個體。

藥物體內過程因人而異，許多因素可影響藥物的吸收、分布、代謝、排泄，從而影響最終的藥效。其他一些因素也可影響藥物的作用，如遺傳、藥物間的相互作用、疾病等。

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