（一）太醫(yī)院

　　鴉片戰(zhàn)爭以前，清代醫(yī)事制度多沿襲明朝舊制。順治元年（1644）設(shè)太醫(yī)院為獨立的中央醫(yī)事機構(gòu)。為帝后及宮內(nèi)人員診視疾病、配制藥物，也擔(dān)負其他醫(yī)藥事務(wù)。最初設(shè)院使一人（正五品），左右院判各一人（正六品），掌太醫(yī)院事。其下設(shè)御醫(yī)10人、吏目30人、醫(yī)士40人、醫(yī)生20人、切造醫(yī)生20人，分掌所屬事務(wù)。以后歷朝，院官員額各有增減，雍正八年（1730）添設(shè)食糧醫(yī)員30人。乾隆二年（1737）題準食糧醫(yī)員之設(shè)永為定例。自院使以下各官具為漢缺，乾隆五十八年（1793）特簡滿大臣一人，管理院務(wù)。

　　院官的升除。院使由左院判升補，左院判由右院判轉(zhuǎn)補，右院判由御醫(yī)升補。御醫(yī)、吏目、醫(yī)士等官，初由各省選舉精通醫(yī)理的人報太醫(yī)院，由院考選補用。

　　（二）御藥房

　　御藥房是供應(yīng)宮內(nèi)所需藥物的炮制及各型成藥加工制備的機構(gòu)，醫(yī)學(xué)|教育網(wǎng)搜集整理順治十年（1653）設(shè)，屬總管首領(lǐng)內(nèi)監(jiān)經(jīng)理。康熙三十年（1691）裁總管首領(lǐng)內(nèi)監(jiān)，改派內(nèi)管領(lǐng)一人，副內(nèi)管二人兼管。

　　御前藥房分東西二所，由太醫(yī)院醫(yī)官輪流為皇帝值班。西御藥房由院使、院判、御醫(yī)、吏目分班侍直，叫作“宮直”。東御藥房由御醫(yī)、吏目、醫(yī)士分班侍直，叫作“六直”。

　　圓明園藥房、西范壽藥房，太醫(yī)院亦如給事于內(nèi)廷，都派醫(yī)官侍直?；实垩残?，院官或奉旨特派，或按班輪委隨駕侍直。

　　（三）藥庫

　　藥庫，也稱生藥庫。由醫(yī)士中選委二員管理藥庫，買辦藥材，二年一換，升授吏目。凡各省出產(chǎn)藥材地方，每年照例解運藥材，交納藥庫由管庫委官驗收貯存。其藥材均以生藥交進，經(jīng)管理藥庫醫(yī)官驗看，由御藥房處于差役地位的“蘇拉醫(yī)生”或以民間召募的“民醫(yī)生”切造、炮制備用。

　　清代對東北地區(qū)所產(chǎn)人參實行皇家專采專賣制度，作為最高統(tǒng)治者宮廷特供生活的重要經(jīng)濟來源和保障。因之，御藥房的人參使用，控制較嚴，實行交請應(yīng)用辦法，無定額限制，用完時，開明耗費數(shù)量，并將需用數(shù)及職名奏呈，再行請用。

　　（四）社會撫恤組織

　　清初仿照明朝制，有施藥例。順治間曾在北京景山東門外建藥房，醫(yī)學(xué)|教育網(wǎng)搜集整理令醫(yī)官給滿漢軍民施藥，康熙中期曾一度擴充，在五城地方設(shè)廠施藥，至四十年（1701）停止。

　　清代統(tǒng)治者及地主、豪紳、為了緩和階級矛盾，興辦有養(yǎng)濟院、普安堂、育嬰堂及粥廠等，讓會撫恤組織，收養(yǎng)社會上的貧孤無靠者，以示恩澤民眾。

　　養(yǎng)濟院明代已有，英宗天順間諭戶部令順天府在大興、宛平二縣各設(shè)養(yǎng)濟院一所。清沿前代例，在京都及全國各地設(shè)置養(yǎng)濟院，養(yǎng)贍鰥孤寡獨，殘疾無依靠的人，政府撥給銀兩和口糧，地方士紳有樂于資助者，任其捐獻。乾隆間還把年逾六十或成篤疾者、不能食力的軍流等犯人，撥入養(yǎng)濟院，按名給孤貧糧。

　　京城及外省還有普濟堂，收養(yǎng)無依靠的體弱多病老年人。乾隆初年定，大口日給米八合，小口減半。

　　我國自古以來把“慈幼”視為美德，宋淳佑間，創(chuàng)立慈幼局收養(yǎng)道路遺棄初生嬰孩。清代則有育嬰堂創(chuàng)立，收養(yǎng)拋棄或無力養(yǎng)育的嬰兒。